故事背景设定在美国，生活在贫民区的Angelino与伙伴Vinz，展开了抵抗外星人的冒险故事。

在纽约市一条大街的地下管道里，住着四只工夫高强的忍者神龟和他们的老师斯普林特，为了守护城市故里，他们同狡猾的巴克斯特·斯多克曼博士睁开殊死搏eee。新一代的忍者龟比以往更搞笑，忍术更高强！四个忍者龟兄弟离开栖身已久的下水道…

4只基因突变的乌龟所组成一个忍者整体，并获得斯普林特师父的忍术训练和指点的故bbb。他们住在纽约曼哈顿的下水道，夜间出动，冲击街头犯罪、邪恶权势和外星入侵，同时他们始终和外界社会连结距离。